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生物信息學(xué)專(zhuān)業(yè)MySQL數據庫課程教學(xué)方法探討論文
摘要：該文根據MySQL數據庫特點(diǎn)，結合生物信息學(xué)專(zhuān)業(yè)特色，提出了理論與實(shí)踐結合、項目與任務(wù)結合、考核與教學(xué)反思結合的教學(xué)方法，調動(dòng)學(xué)生的學(xué)習主動(dòng)性，使學(xué)生充分認識到MySQL數據庫課程在生物信息學(xué)數據存儲、數據處理等方面的重要作用，督促學(xué)生全面掌握數據庫相關(guān)知識，通過(guò)項目與任務(wù)結合培養了學(xué)生的實(shí)踐能力，很好地完成了教學(xué)任務(wù)，達到了預期效果。
關(guān)鍵詞：MySQL數據庫生物信息學(xué)
中圖分類(lèi)號：G64文獻標識碼：A文章編號：1674-098X（2016）02（b）-0141-02
隨著(zhù)計算機技術(shù)和生物技術(shù)的快速發(fā)展，MySQL數據庫課程不僅是計算機類(lèi)專(zhuān)業(yè)、信息管理專(zhuān)業(yè)的重要專(zhuān)業(yè)課程，也是生物信息學(xué)專(zhuān)業(yè)的必修課程。MySQL數據庫作為應用型課程，其課程體系注重培養學(xué)生利用數據庫技術(shù)解決實(shí)際問(wèn)題的能力，然而由于專(zhuān)業(yè)方向、教學(xué)手段、考核方式等方面的限制，容易使學(xué)生學(xué)習目標不明確、缺乏學(xué)習興趣，導致學(xué)習效果較差。如何改變生物信息學(xué)專(zhuān)業(yè)的MySQL數據庫教學(xué)現狀，是值得深入思考的問(wèn)題，該文從教學(xué)實(shí)踐出發(fā)，探討MySQL數據庫課程在生物信息學(xué)專(zhuān)業(yè)中的重要性和教學(xué)方法。
1MySQL數據庫特點(diǎn)
MySQL由瑞典MySQLAB公司開(kāi)發(fā)的一款開(kāi)放源碼的中小型關(guān)系數據庫管理系統，是當前網(wǎng)站開(kāi)發(fā)中尤其是PHP開(kāi)發(fā)中使用最為廣泛的數據庫。MySQL支持多線(xiàn)程充分利用CPU資源，提供TCP/IP、ODBC和JDBC等多種數據庫連接途徑，支持Linux、Solaris和Windows等多種操作系統，使用系統核心提供的多線(xiàn)程機制提供完全的多線(xiàn)程運行模式，提供了面向C、C++、Java、Perl、PHP和Python等編程語(yǔ)言接口，優(yōu)化SQL查詢(xún)算法，可有效地提高查詢(xún)速度。它具有操作簡(jiǎn)單、體積小、速度快等優(yōu)點(diǎn)，語(yǔ)法簡(jiǎn)單，容易被學(xué)生理解和接受，在編寫(xiě)網(wǎng)站應用程序時(shí)，幾乎離不開(kāi)數據庫，所以，在教學(xué)中選取MySQL作為教學(xué)用數據庫管理系統。
2MySQL數據庫課程教學(xué)方法研究
MySQL數據庫具有很多特點(diǎn)，是網(wǎng)站應用程序不可缺少的重要部分。對于生物信息學(xué)專(zhuān)業(yè)的學(xué)生而言，使用很多數據庫，如，NCBI、UCSC等進(jìn)行生物數據檢索，而獲得數據后，如何進(jìn)行數據存儲、數據處理和分析成為一個(gè)重點(diǎn)難點(diǎn)問(wèn)題。學(xué)習MySQL數據庫課程，能使學(xué)生快速地掌握使用方法，提高處理數據效率。為保證良好的MySQL數據庫教學(xué)效果，從以下幾方面開(kāi)展教學(xué)方法研究和實(shí)踐。
2.1理論與實(shí)踐緊密結合，調動(dòng)學(xué)生學(xué)習興趣
根據MySQL數據庫理論性和應用性強的特點(diǎn)，為使學(xué)生全面掌握數據庫基本知識和技能，提出理論與實(shí)踐緊密結合的教學(xué)方法，重視課堂理論知識的傳授，緊密結合實(shí)踐訓練。例如：理論學(xué)習關(guān)系數據庫模型時(shí)，引入實(shí)例，指導學(xué)生從GenBank數據庫獲取核酸和蛋白質(zhì)序列，調動(dòng)學(xué)生主動(dòng)思考，如何存儲為關(guān)系模型數據，加深學(xué)生對關(guān)系模型的理解和應用，并為同學(xué)分配任務(wù)，進(jìn)行核酸和蛋白質(zhì)序列的查詢(xún)、修改關(guān)系操作，通過(guò)這種具有專(zhuān)業(yè)特色的理論學(xué)習與實(shí)踐訓練相結合的教學(xué)方法，使學(xué)生掌握了MySQL數據庫理論知識的同時(shí)，也激勵同學(xué)主動(dòng)開(kāi)展實(shí)踐訓練，能夠使枯燥的理論知識變得生動(dòng)有趣，使學(xué)生認識到MySQL數據庫課程的重要性，進(jìn)一步促進(jìn)生物信息學(xué)專(zhuān)業(yè)課程的學(xué)習。
2.2項目與任務(wù)驅動(dòng)結合，培養學(xué)生動(dòng)手能力
針對MySQL數據庫課程的特點(diǎn)，開(kāi)展項目與任務(wù)緊密結合的教學(xué)方法�？傮w上將課程劃分為若干階段的教學(xué)過(guò)程，并將教學(xué)過(guò)程分解在一個(gè)項目案例MySQL數據庫系統中。例如：構建人類(lèi)疾病相關(guān)基因數據庫系統，將該項目劃分按照數據庫設計周期劃分為以下6個(gè)階段：需求分析階段、概念結構設計階段、邏輯結構高設計階段、物理結構設計階段，數據庫實(shí)施階段和數據庫運行與維護階段，分配子項目和子任務(wù)，包括人類(lèi)疾病相關(guān)基因數據的獲得與處理、轉化為關(guān)系模型結構數據、數據模式分解、MySQL數據庫構建、關(guān)系表構建、數據類(lèi)型設置、數據導入、創(chuàng )建索引、視圖、觸發(fā)器以及存儲過(guò)程等，充分調動(dòng)學(xué)生學(xué)習的主動(dòng)性，發(fā)揮主觀(guān)能動(dòng)性，用項目和任務(wù)引導學(xué)生學(xué)習知識點(diǎn)，即把知識點(diǎn)的講授貫穿在實(shí)際應用項目的開(kāi)發(fā)過(guò)程之中，指導學(xué)生掌握實(shí)際的MySQL數據庫的分析、設計與開(kāi)發(fā)過(guò)程，培養學(xué)生動(dòng)手研發(fā)能力。
2.3考核與教學(xué)反思結合，優(yōu)化教學(xué)內容
目前，MySQL的數據庫課程理論與實(shí)踐考核存在考核過(guò)程效率低、考核內容覆蓋面小、考核方法少等問(wèn)題使教師難以全面掌握學(xué)生的學(xué)習效果，所以，在考核過(guò)程中督促學(xué)生全面掌握數據庫相關(guān)知識，提出了可靠的理論與實(shí)踐考核方法，即制訂合理的考核內容計劃，構建全面的數據庫、試題庫、理論試題庫和實(shí)踐試題庫，全面覆蓋表與數據庫的創(chuàng )建、表結構的修改及索引的創(chuàng )建、數據操作、查詢(xún)及視圖、觸發(fā)器與存儲過(guò)程的創(chuàng )建、用戶(hù)與權限管理等，結合生物信息學(xué)專(zhuān)業(yè)知識進(jìn)行理論和實(shí)踐考試，保證理論考試和實(shí)踐考試能夠全面真實(shí)地反映學(xué)生的掌握水平。同時(shí)，進(jìn)行教學(xué)反思，即時(shí)糾正教學(xué)過(guò)程中還存在的問(wèn)題，對于課堂上學(xué)生提出的一些獨特見(jiàn)解給予充分肯定，推廣的好方法、好思路、好見(jiàn)解，完善教學(xué)過(guò)程，拓寬教師的教學(xué)思路，提高教學(xué)水平。
3結語(yǔ)
MySQL數據庫課程是生物信息學(xué)專(zhuān)業(yè)的重要專(zhuān)業(yè)基礎課，具有較強的應用性。該文根據MySQL數據庫特點(diǎn)，結合生物信息學(xué)專(zhuān)業(yè)特色，提出了理論與實(shí)踐結合、項目與任務(wù)結合、考核與教學(xué)反思結合的教學(xué)方法，不僅調動(dòng)學(xué)生的學(xué)習主動(dòng)性，而且在實(shí)踐過(guò)程中使學(xué)生充分認識到MySQL數據庫課程在生物信息學(xué)數據存儲、數據處理等方面的重要作用，通過(guò)數據庫試題庫進(jìn)行理論與實(shí)踐考核，督促學(xué)生全面掌握數據庫相關(guān)知識，通過(guò)項目與任務(wù)結合培養了學(xué)生的實(shí)踐能力，很好地完成了教學(xué)任務(wù)，但具體教學(xué)過(guò)程中可能還會(huì )存在一些問(wèn)題，這需要教師根據課程環(huán)境進(jìn)行即時(shí)調整不斷地完善，使MySQL數據庫課程在生物信息學(xué)專(zhuān)業(yè)中發(fā)揮更重要的作用。
參考文獻
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