基礎醫學(xué)網(wǎng)絡(luò )信息資源整合及應用論文
基礎醫學(xué)在醫藥衛生領(lǐng)域起著(zhù)舉足輕重的作用。多年以來(lái)，我國基礎醫學(xué)研宄在疑難病癥的病因、病理、病程發(fā)展等方面取得了卓有成效的成果⑴�；A醫學(xué)研宄離不開(kāi)信息資源的支持。目前網(wǎng)絡(luò )中積累的基礎醫學(xué)資源主要包括人體生理心理相關(guān)數據、基因序列、蛋白質(zhì)圖譜、可視人體圖像等。歐美一些發(fā)達國家醫學(xué)信息網(wǎng)絡(luò )化建設起步較早，資源的網(wǎng)絡(luò )化服務(wù)也比較成熟。像歐洲的EMBL、美國的NCBI、日本的DDBJ都建立了多個(gè)大型的基因數據庫和蛋白質(zhì)結構數據庫，實(shí)現數據的同步交換和更新，成為基礎醫學(xué)研宄必需的資源獲取平臺。我國基礎醫學(xué)資源較為分散，主要存儲在不同的科研單位，多以小型專(zhuān)業(yè)數據庫的形式為用戶(hù)提供服務(wù)，有各自的訪(fǎng)問(wèn)路徑和查詢(xún)接口，服務(wù)方式和資源類(lèi)型都較為單一。如何在這些來(lái)源廣泛、類(lèi)型不同的資源之間建立聯(lián)系，滿(mǎn)足用戶(hù)全面的資源獲取需求，提高資源的利用率和共享率，是我國基礎醫學(xué)研宄必須面對的一大問(wèn)題[2]。目前，解決這一問(wèn)題的方法是實(shí)現基礎醫學(xué)資源整合。
1資源整合的意義
1。1為科研工作提供便利
科研水平的進(jìn)步和科研內容的豐富使基礎醫學(xué)研宄過(guò)程中對科學(xué)數據資源的需求不斷提高[4]�；A醫學(xué)的研宄是多個(gè)學(xué)科的交叉和融合。通過(guò)整合基礎醫學(xué)資源，科研人員可以通過(guò)一次檢索獲取多個(gè)學(xué)科的相關(guān)信息，提高了他們的信息資源
�、僦袊t學(xué)科學(xué)院基礎醫學(xué)研究所，北京協(xié)和醫學(xué)院流行病與衛生統計學(xué)系
�、谥袊t學(xué)科學(xué)院基礎醫學(xué)研究所，北京協(xié)和醫學(xué)院網(wǎng)絡(luò )中心
�、壑袊t學(xué)科學(xué)院基礎醫學(xué)研究所，北京協(xié)和醫學(xué)院基礎學(xué)院病原生物學(xué)系分子寄生蟲(chóng)實(shí)驗室北京100005*基金項目：科技部國家科技基礎條件平臺科學(xué)數據共享工程重大項目。
獲取能力�；A醫學(xué)資源整合提高了現有數據資源的利用率，避免了科研的重復投資1。2為政府決策提供支持基礎醫學(xué)資源整合可以讓有關(guān)部門(mén)對我國基礎醫學(xué)科研現狀整體把握，能夠更為科學(xué)地判斷基礎醫學(xué)研宄熱點(diǎn)，實(shí)現科研資金的合理分配，提高科研效率。通過(guò)對整合資源的系統分析，能夠提高數據分析的質(zhì)量[5]，為我國政府衛生管理政策的制定
和衛生決策的實(shí)施提供更為有力的支持。
1。3加強基礎醫學(xué)資源管理
目前基礎醫學(xué)數據資源呈現電子化、網(wǎng)絡(luò )化、分布性、無(wú)序性等特點(diǎn)這給資源有效管理和合理調配帶來(lái)很大困難。通過(guò)資源整合可以有效地實(shí)現數據資源的統一管理，實(shí)現科研成就的傳承和利用。
2基礎醫學(xué)資源整合建設
近年來(lái)，我國政府極為重視科學(xué)數據共享，己經(jīng)將其作為一項戰略選擇納入國家科技基礎條件平臺建設�；A醫學(xué)科學(xué)數據共享網(wǎng)（http/pic/p>
2。1資源整合的實(shí)現
2。1。1資源來(lái)源：共享網(wǎng)自2004年正式投入建設并對外公開(kāi)發(fā)布以來(lái)，本著(zhù)“邊建設，邊服務(wù)”的原則，得到全國范圍內多家科研單位和高等院校的支持和響應。目前共享網(wǎng)共整合了來(lái)自清華大學(xué)、北京大學(xué)、中科院生物物理所、北京華大基因、中國醫學(xué)科學(xué)院、軍事醫學(xué)科學(xué)院等10多家單位的25個(gè)數據庫資源^根據數據內容的不同，共享網(wǎng)將整合的25個(gè)數據庫分為以下4類(lèi)：1）人群調查及人體數據資源包括中國人生理常數數據庫、中國人心理狀況數據庫、中國數字化可視人體數據庫、中國人群亞健康現狀調查數據庫及中國婦女和兒童營(yíng)養狀況數據庫、中國人群心血管健康研宄數據庫共6個(gè)^（2）分子機制類(lèi)數據資源包括非編碼RNA數據庫、神經(jīng)突觸數據庫、人類(lèi)腫瘤相關(guān)抗原數據庫、人類(lèi)肝臟蛋白質(zhì)組表達譜數據庫、人類(lèi)尿蛋白質(zhì)數據庫等共13個(gè)數據庫。（3）模式生物類(lèi)數據資源包括動(dòng)物模型基因組數據庫、基因組多態(tài)性圖譜數據庫、模式生物基因組數據庫和轉錄因子數據庫4個(gè)^（4）實(shí)驗材料數據資源包括實(shí)驗細胞數據庫和遺傳工程小鼠品系基本表型數據庫。
2。1。2整合技術(shù)：共享網(wǎng)采用門(mén)戶(hù)技術(shù)（Portal）來(lái)實(shí)現資源整合。門(mén)戶(hù)是一個(gè)應用框架，它能將各種應用系統、數據資源集成到一個(gè)信息管理平臺上，并以統一的用戶(hù)界面提供服務(wù)。利用門(mén)戶(hù)中的內容管理系統（contentmanagementsystem，CMS）將各個(gè)數據庫整合到共享平臺中，為用戶(hù)提供一站式的資源瀏覽和檢索系統，避免了信息冗余和查詢(xún)重復，提高信息獲取效率。共享網(wǎng)對整合的數據資源采用Oracle數據庫進(jìn)行管理，并用WindowsServer2003服務(wù)器對外提供服務(wù)。
2。2資源整合管理
資源整合的關(guān)鍵是把好數據質(zhì)量關(guān)。為保證資源質(zhì)量，共享網(wǎng)成立了專(zhuān)門(mén)的學(xué)術(shù)委員會(huì )，聘請國內基礎醫學(xué)領(lǐng)域的院士、專(zhuān)家擔任委員會(huì )成員，對申請加入共享網(wǎng)的數據資源從數據量、數據服務(wù)、數據質(zhì)量、科研成果等多個(gè)方面嚴格審查，確保每個(gè)整合資源的科學(xué)性和實(shí)用性。
根據基礎醫學(xué)數據量大，數據類(lèi)型多樣的特點(diǎn)，共享網(wǎng)對整合的數據資源采用元數據方式統一管理。元數據（metadata）是關(guān)于數據的數據，是描述、定位、檢索、利用、管理信息資源的結構化信息。利用元數據對基礎醫學(xué)信息資源進(jìn)行開(kāi)發(fā)和描述，統一定義各種數據資源的基本信息和功能，為用戶(hù)使用提供方便。
3資源整合中的問(wèn)題及對策
3。1資源整合中存在的問(wèn)題
3。1。1數據標準不統一：由于基礎醫學(xué)資源類(lèi)型多樣，數據編碼和組織方式都差別較大，數據管理沒(méi)有統一的標準，為資源整合帶來(lái)了很大的麻煩。
3。1。2資源管理不規范：有些基礎醫學(xué)資源涉及到保密性或安全性等問(wèn)題，沒(méi)有完善的管理辦法對其進(jìn)行合理規劃，并且資源整合還面臨資源所有權、知識產(chǎn)權及個(gè)人隱私等問(wèn)題，給資源整合帶來(lái)不便。
3。1。3多數單位配合積極性不高：目前我國科學(xué)數據共享相關(guān)政策和法律法規尚不完善，缺乏相應的補償機制和激勵機制，致使共享積極性不高，共享觀(guān)念淡薄。一些數據資源被視為個(gè)人或單位所有，使得長(cháng)期積累的數據資源無(wú)法實(shí)現更高的科學(xué)價(jià)值。
3。1。4數據分類(lèi)和編碼紊亂：基礎醫學(xué)研宄己經(jīng)積累了大量的科學(xué)數據，但是這些科學(xué)數據資源缺乏系統化的歸納、層次化的標識和規范化的表達，缺乏統一的、可操作的資源調查、規劃、設計與描述，導致科學(xué)數據資源使用效率低。數據格式的不同導致描述和管理的差異，給資源整合帶來(lái)困難。
3。1。5復合型人才匱乏：基礎醫學(xué)資源整合需要具備掌握基礎醫學(xué)知識、軟件開(kāi)發(fā)技術(shù)和資源管理方法的復合型人才。而目前從事資源整合工作的人員大多只具備單一領(lǐng)域的知識背景，難以實(shí)現明確的需求分析和充分的知識交流。
34解決方案
3。2。1做好資源規劃工作：為了促進(jìn)共享網(wǎng)資源整合有計劃、
可持續發(fā)展，必須要加強領(lǐng)導和管理，統籌規劃基礎醫學(xué)各類(lèi)資源的實(shí)質(zhì)性整合，加速從信息孤島向實(shí)現信息高度共享和網(wǎng)絡(luò )互聯(lián)的模式轉換[8]。同時(shí)對網(wǎng)絡(luò )中基礎醫學(xué)資源進(jìn)行追蹤考察，全程管理，確�；A醫學(xué)資源整合的遠期效果[1]。
3。22制定標準和規范：標準化是實(shí)現資源共享的根本要求。沒(méi)有統一的標準，就不能實(shí)現真正意義上的資源共享[9]。在基礎醫學(xué)資源整合的同時(shí)，要從我國國情出發(fā)，建立一套符合我國資源現狀的、能夠與國際接軌的標準規范，指導共享網(wǎng)建設科學(xué)高效進(jìn)行。
3。23制定相應的法規政策：根據我國資源整合面臨的實(shí)際困難，國家有關(guān)部門(mén)應該建立健全資源整合的法律法規，明確規定科學(xué)數據共享原則，界定數據共享范圍。同時(shí)建立相應的補償機制，出臺督促賞罰措施。只有這樣才能使科學(xué)數據共享有法可依，促進(jìn)科學(xué)數據管理和共享，使其潛在的價(jià)值得以充分發(fā)揮[5]。
3。24做好數據分類(lèi)和編碼：實(shí)現基礎醫學(xué)資源整合要加強數據分類(lèi)的研宄，提高醫藥衛生數據資源的管理和共享程度[7]。
3。25培養多學(xué)科交叉的復合型人才：人才建設是保證資源整合建設長(cháng)期發(fā)展的前提。因此在資源整合的過(guò)程中應該針對基礎醫學(xué)的專(zhuān)業(yè)性需求，培養一批優(yōu)秀的跨學(xué)科人才，保證資源整合的技術(shù)創(chuàng )新性和服務(wù)全面性。
4小結
基礎醫學(xué)科學(xué)數據作為一種科研資源其價(jià)值只有廣泛傳播和使用才能更大程度地發(fā)揮。通過(guò)建立共享網(wǎng)實(shí)現資源的實(shí)質(zhì)性?xún)?yōu)化整合和廣泛性互補共享[8]，為廣大的基礎醫學(xué)工作者提供方便的信息獲取渠道，以科學(xué)的理念、合理的機制，使整合資源達到更高層次的完美結合[1]。共享網(wǎng)建設本著(zhù)“物理上合理分布、層次分明，邏輯上高度統一、充分共享”的建設宗旨，力爭建立一個(gè)提供“健康一亞健康一疾病”的一體化健康信息服務(wù)，為健康管理、疾病預防、藥品研發(fā)和臨床診治提供全面支持的綜合性基礎醫學(xué)資源平臺。
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