自動(dòng)化學(xué)院的歷史可追溯到1953年“哈軍工”時(shí)期，它是在“哈軍工”時(shí)期的“海道測量”和“船電”兩個(gè)專(zhuān)業(yè)的基礎上發(fā)展壯大起來(lái)的。自動(dòng)化學(xué)院是我校教學(xué)和科研的支柱骨干單位之一，設有“自動(dòng)化”、“測控技術(shù)與儀器”、“電氣工程及其自動(dòng)化”、“探測制導與控制技術(shù)”、“生物醫學(xué)工程”5個(gè)本科專(zhuān)業(yè)，具有“控制理論與控制工程”、“導航、制導與控制”、“模式識別與智能系統”、“檢測技術(shù)與自動(dòng)化裝置”、“電力電子與電力傳動(dòng)”、“電力系統及其自動(dòng)化”、“精密儀器及機械”、“生物醫學(xué)工程”、“機械電子工程”9個(gè)碩士學(xué)位授予權，具有“控制理論與控制工程”、“導航、制導與控制”、“精密儀器及機械”3個(gè)博士學(xué)位授予權，具有一級學(xué)科“控制科學(xué)與工程”博士后科研流動(dòng)站、2001年“導航、制導與控制”學(xué)科被評為國家級重點(diǎn)學(xué)科。在國家“十五”“211工程”部門(mén)預審和立項中，“控制理論與控制工程”、“導航、制導與控制”兩學(xué)科被列為重點(diǎn)建設學(xué)科，投資建設經(jīng)費達2300萬(wàn)元，目標是達到國際先進(jìn)水平。

　　該學(xué)院現有教師136人，教授和研究員32人(其中博士生導師19人)，副教授和高級工程師39人。有40%的教師曾赴美國、德國、加拿大、英國、瑞典、日本等國家學(xué)習、進(jìn)修或合作研究。

　　該學(xué)院具有雄厚的科研實(shí)力和科研特色。近年來(lái)，獲國家級科技獎12項，省部級獎50多項。其中艦船減搖控制技術(shù)、微機組合導航技術(shù)達到國際先進(jìn)水平，處于國內領(lǐng)先水平。在國內外刊物及學(xué)術(shù)會(huì )議上發(fā)表學(xué)術(shù)論文600余篇，其中國際學(xué)術(shù)刊物或會(huì )議論文70余篇，國家級學(xué)術(shù)刊物250余篇，出版學(xué)術(shù)著(zhù)作50余部。

　　該學(xué)院已為國家培養本科生3100余人，研究生485人，其中絕大部分已成為國家經(jīng)濟建設、國防建設、科學(xué)研究和高等教育等方面的骨干。目前在該學(xué)院就讀的本科生有1972人，碩士研究生305人，博士研究生134人，博士后研究人員11人。

　　該學(xué)院的學(xué)生除可獲得學(xué)校獎學(xué)金及“特困生資助金”外，學(xué)院還設立了多種鼓勵學(xué)生學(xué)習的獎勵基金。學(xué)生學(xué)習風(fēng)氣濃厚，每年有約40%的學(xué)生保送或考取碩士研究生。1998年以來(lái)，該學(xué)院已有11名本科生被派往日本學(xué)習。