中國科學(xué)技術(shù)大學(xué)工程科學(xué)學(xué)院成立于1998年，由當時(shí)的 力學(xué)和機械工程系、精密機械與精密儀器系以及熱科學(xué)和能源工程系組成。伍小平院士、崔爾杰院士先后擔任過(guò)本學(xué)院院長(cháng)，現任院長(cháng)為杜善義院士。力學(xué)和機械工 程系原名近代力學(xué)系，系功勛科學(xué)家錢(qián)學(xué)森院士于1958年創(chuàng )建，并任系主任直至1978年;1992年更名為力學(xué)和機械工程系，2007年恢復為近代力學(xué) 系。熱科學(xué)和能源工程系的前身——工程熱物理系為著(zhù)名科學(xué)家吳仲華院士于1958年創(chuàng )建，并任系主任至1960年;此后該系撤銷(xiāo)，且作為工程熱物理專(zhuān)業(yè)并 入近代力學(xué)系;1983年該專(zhuān)業(yè)恢復成為工程熱物理系，1992年更名為熱科學(xué)和能源工程系。精密機械與精密儀器系為1978年在近代力學(xué)系基礎教研室的 基礎上創(chuàng )建的;而該教研室的前身則是1958年建校時(shí)成立的校機電工程教研室(承擔全校工程基礎教學(xué))的機械教研組，該教研組于1963年并入近代力學(xué) 系。2004年依托我�；馂目茖W(xué)國家重點(diǎn)實(shí)驗室而建立的安全科學(xué)與工程系，掛靠在工程科學(xué)學(xué)院;2001年按錢(qián)學(xué)森先生倡導成立的中國科學(xué)院材料力學(xué)行為 和設計重點(diǎn)實(shí)驗室也屬工程科學(xué)學(xué)院。
工程科學(xué)(Engineering Science)也稱(chēng)技術(shù)科學(xué)，屬于應用科學(xué)層次，是自然科學(xué)和工程技術(shù)之間的橋梁�？拼蠼ㄐr(shí)諸多的系科定位于工程科學(xué)，這些系科與傳統的工學(xué)院的相關(guān) 系科是不同的。前者面向工程科學(xué)，主要培養解決工程中科學(xué)問(wèn)題的研究型人才;后者直接面向工程技術(shù)，主要培養工程技術(shù)人才。實(shí)際上，設置諸多的工程科學(xué)類(lèi) 型的系科，是科大先進(jìn)的辦學(xué)思想之一——“科學(xué)與技術(shù)相結合，理與工相結合”的重要組成部分�，F代科學(xué)技術(shù)的進(jìn)步，特別是高新技術(shù)的飛速發(fā)展，給工程科學(xué) 的發(fā)展注入了新的活力，也向工程科學(xué)提出了新的挑戰。工程科學(xué)學(xué)院就是在這樣的背景下組合相關(guān)的系科而成立的，旨在整合有限的資源，促進(jìn)學(xué)科之間的交叉融 合，尤其是促進(jìn)工程科學(xué)與高新技術(shù)之間的交叉融合。
近五十年來(lái)，工程科學(xué)的相關(guān)系科及其專(zhuān)業(yè)設置已經(jīng)發(fā)生了諸多的變革，但這些變革始終沒(méi)有偏離科大另一個(gè)先進(jìn)的辦學(xué)思想——“面向科技前沿、重基礎、寬口徑地 培養研究型科技人才”。所謂“重基礎、寬口徑”是指重視數理基礎和工程基礎;但基礎科學(xué)(理科)和工程科學(xué)的系科對工程基礎的要求程度是不同的，前者側重 工程基礎知識，后者不僅要求掌握工程基礎知識，還要求具備相當的工程技術(shù)能力。工程科學(xué)學(xué)院成立后，整合了原有相關(guān)系科的教學(xué)實(shí)驗室，充分利用學(xué)校投資建 立了工程基礎實(shí)驗教學(xué)中心，該中心更多更系統地體現了高新技術(shù)對工程基礎的滲透，從而促進(jìn)了工程基礎教學(xué)的發(fā)展。所謂的“面向科技前沿”是指讓高年級學(xué)生 以選修課的方式，以及去相關(guān)的前沿科研實(shí)驗室(中科院或本校的)參加一定的科研實(shí)踐;這樣不僅能開(kāi)拓學(xué)生的視野，接觸科技前沿，而且能夠鍛煉學(xué)生的實(shí)際工 作能力，更有利于培養學(xué)生“理實(shí)交融”的品格。目前工程科學(xué)學(xué)院設有5個(gè)本科專(zhuān)業(yè)(參見(jiàn)相關(guān)系科的介紹)，即理論與應用力學(xué)、機械設計制造及其自動(dòng)化、測 控技術(shù)與儀器、熱能科學(xué)和動(dòng)力工程專(zhuān)業(yè)以及安全科學(xué)工程專(zhuān)業(yè)。理論與應用力學(xué)專(zhuān)業(yè)為全國僅有的兩個(gè)理科力學(xué)人才培養基地之一。在科大諸多先進(jìn)的辦學(xué)思想指 導下，在中國一代工程科學(xué)宗師的直接指導下，較快地形成了科大工程科學(xué)系科鮮明的辦學(xué)特色，培養了一大批深受社會(huì )認可和歡迎的優(yōu)秀的本科畢業(yè)生。畢業(yè)于六 十和七十年代的本科生主要進(jìn)入中科院相關(guān)研究所、國防尖端部門(mén)和國家主要的產(chǎn)業(yè)和事業(yè)部門(mén)，并成為這些單位的骨干、學(xué)術(shù)或技術(shù)帶頭人或領(lǐng)導人，為國防尖端 事業(yè)做出了重大貢獻;有6名畢業(yè)生當選為兩院院士。八十年代以后畢業(yè)的本科生中，有70%以上進(jìn)入國內外著(zhù)名大學(xué)、研究機構深造，其余直接參加工作，他們 均成為各行各業(yè)的棟梁，甚至國內外有影響的人物。