20世紀50年代末，在全國“大辦農業(yè)，大辦糧食”熱潮中，為適應上海經(jīng)濟發(fā)展和文化建設的需要，上海市委作出了建立上海農學(xué)院(上海交通大學(xué)農業(yè)與生物學(xué)院前身)的決定。1959年，上海農學(xué)院應運而生，校址設在松江縣(現松江區)城北。這是上海市歷史上的第一所由地方政府主辦的高等農業(yè)院校，掀開(kāi)了上海高等農業(yè)教育的新篇章。1963年8月，因國家出現經(jīng)濟、財政困難，上海農學(xué)院停辦。1978年10月，上海農學(xué)院在上�？h七寶(現屬閔行區)恢復重建。1999年9月，上海農學(xué)院并入上海交通大學(xué)，成立上海交通大學(xué)農學(xué)院。2002年3月，更名為上海交通大學(xué)農業(yè)與生物學(xué)院。2009年5月，進(jìn)入教育部、農業(yè)部合作共建全國八所涉農高校行列。
并校以來(lái)，學(xué)院緊密?chē)@“創(chuàng )建世界一流農科”戰略主線(xiàn)，形成并確立了“以農為本、需求牽引、特色發(fā)展、爭創(chuàng )一流”的辦學(xué)指導思想，著(zhù)力加強學(xué)科建設、培養與引進(jìn)高層次人才，努力提高辦學(xué)層次、提升人才培養質(zhì)量，各項事業(yè)取得了跨越式發(fā)展。學(xué)院現有全日制本科專(zhuān)業(yè)5個(gè)(植物科學(xué)與技術(shù)、動(dòng)物科學(xué)、園林、資源環(huán)境科學(xué)、食品科學(xué)與工程)，一級學(xué)科碩士學(xué)位授權點(diǎn)7個(gè)(園藝學(xué)、畜牧學(xué)、生態(tài)學(xué)、食品科學(xué)與工程、風(fēng)景園林學(xué)、植物保護、農業(yè)工程)，二級學(xué)科碩士學(xué)位授權點(diǎn)2個(gè)(預防獸醫學(xué)、作物遺傳育種)，一級學(xué)科博士學(xué)位授權點(diǎn)3個(gè)(園藝學(xué)、生態(tài)學(xué)、生物醫學(xué)工程)，專(zhuān)業(yè)碩士學(xué)位授權點(diǎn)4個(gè)(農業(yè)推廣、獸醫、風(fēng)景園林、食品工程)。擁有上海市重點(diǎn)學(xué)科1個(gè)(蔬菜學(xué))，建有蔬菜學(xué)、生態(tài)學(xué)博士后科研流動(dòng)站。教職工215人(專(zhuān)任教師135人)，其中正高職稱(chēng)教師 50人，副高職稱(chēng)教師56人，具有博士學(xué)位的教師124人(海外博士28人)，一年以上海外學(xué)習經(jīng)歷的教師94人，“長(cháng)江學(xué)者”特聘教授1人，講席教授6人。截至2013年9月，全日制在校生1084人，其中本科生603人、研究生481人(博士生178人)。
學(xué)院堅持走“頂天”、“立地”“一體兩翼”式發(fā)展道路，以農業(yè)與生物學(xué)院為實(shí)體，利用學(xué)校多學(xué)科優(yōu)勢，注重與工科、理科、醫科和管理學(xué)科的交叉融合，努力打造高層次的“頂天”科技創(chuàng )新隊伍，致力于農業(yè)應用基礎研究和開(kāi)發(fā)研究，為農業(yè)技術(shù)創(chuàng )新提供源頭;以?huà)炜繉W(xué)院的上海交通大學(xué)新農村發(fā)展研究院為載體，探索農業(yè)科技推廣專(zhuān)兼職隊伍長(cháng)效機制，加快建設高水平的“立地”農業(yè)科技推廣隊伍，專(zhuān)注于農業(yè)科研成果的轉化和推廣，為國家的農業(yè)現代化和社會(huì )主義新農村建設服務(wù)。學(xué)院圍繞現代農業(yè)與人類(lèi)健康，著(zhù)力加強農業(yè)科技創(chuàng )新、農業(yè)科技推廣平臺基地建設，不斷提升科研水平和質(zhì)量，在農業(yè)優(yōu)質(zhì)新品種與資源利用、食品安全與營(yíng)養、農業(yè)環(huán)境與生態(tài)安全保障、人獸共患疫病的防控、園林生態(tài)與景觀(guān)等多個(gè)方向形成特色�，F擁有新農村發(fā)展研究院(國家級)、農業(yè)部都市農業(yè)(南方)重點(diǎn)實(shí)驗室、上海市獸醫生物技術(shù)重點(diǎn)實(shí)驗室、上海市食品安全工程技術(shù)研究中心等國家級、省部級研究基地。近三年(2011-2013)，科研到位經(jīng)費總計 2.1億元，獲批千萬(wàn)級國家項目3項，國家自然科學(xué)基金立項資助項目56項(重點(diǎn)項目2項);發(fā)表SCI/EI論文433篇，專(zhuān)利授權(含軟件著(zhù)作權)194項，新品種審定24項。以我院為第一完成單位獲國家科技進(jìn)步獎二等獎1項，教育部科技進(jìn)步一等獎2項，上海市科技進(jìn)步二等獎1項。
學(xué)院積極探索綜合性大學(xué)農科創(chuàng )新人才培養模式，高度重視學(xué)生創(chuàng )新精神和實(shí)踐能力培養。2009年，我院改革本科生招生辦法，啟動(dòng)實(shí)施提前批次招生，與上海市農委簽訂聯(lián)合培養農科人才協(xié)議，定向培養新農村建設高端人才。2008、2010、2012年，學(xué)院學(xué)生牽頭組建的創(chuàng )業(yè)計劃項目連續三屆闖入“挑戰杯” (第六、第七、第八)中國大學(xué)生創(chuàng )業(yè)計劃大賽決賽，摘得2金1銀佳績(jì);2011年，推薦的科技創(chuàng )新項目獲第十二屆“挑戰杯”全國大學(xué)生科技作品競賽二等獎;2011、2012、2013年連續三年獲評團中央暑期社會(huì )實(shí)踐重點(diǎn)團隊(2012年囊括學(xué)校僅有的2支團中央重點(diǎn)團隊)，獲評上海市大學(xué)生暑期社會(huì )實(shí)踐活動(dòng)優(yōu)秀項目獎多項，2012年獲評交大唯一的上海市社會(huì )實(shí)踐最佳項目獎。
學(xué)院不斷深化對外合作與交流，先后與美國康奈爾大學(xué)、羅格斯大學(xué)、普渡大學(xué)、英國諾丁漢大學(xué)、英國皇家獸醫學(xué)院、荷蘭瓦格寧根大學(xué)、日本千葉大學(xué)、京都大學(xué)等30多個(gè)世界知名學(xué)校和科研機構建立了良好的合作關(guān)系。建有中美食品安全聯(lián)合研究中心(科技部注冊)、交大- 復旦- 諾丁漢植物生物技術(shù)研發(fā)中心、上海交通大學(xué)陸伯勛食品安全研究中心、上海交通大學(xué)-普渡大學(xué)惠斯特勒碳水化合物聯(lián)合研究中心等國際科研合作機構。2004 年，學(xué)院率先與全球農科排名第一的美國康奈爾大學(xué)農業(yè)與生命學(xué)院形成戰略伙伴，后分別與羅格斯大學(xué)、普渡大學(xué)等知名院校簽訂了學(xué)生聯(lián)合培養協(xié)議。目前，已有20余名本科生通過(guò)2+2項目獲得了雙學(xué)位，并順利進(jìn)入耶魯大學(xué)、布朗大學(xué)等常青藤大學(xué)攻讀碩士、博士學(xué)位。學(xué)院還與日本住友化學(xué)株式會(huì )社、美國食品飲料和消費品制造商協(xié)會(huì )等世界知名企業(yè)簽署了合作意向書(shū)，開(kāi)展生態(tài)農場(chǎng)和食品安全領(lǐng)域的合作。
風(fēng)雨兼程自強不息，承前啟后再創(chuàng )輝煌。展望未來(lái)，學(xué)院將堅持“以農為本、需求牽引、特色發(fā)展、爭創(chuàng )一流”的辦學(xué)指導思想，努力實(shí)現創(chuàng )建世界一流農科的戰略目標，通過(guò)學(xué)科、組織、人員三大結構調整，以未來(lái)國家農業(yè)發(fā)展的重大科技問(wèn)題和戰略需求為導向，以創(chuàng )新的系所矩陣式混合組織結構、團隊制管理模式為核心，以“一體兩翼”的結構模式，“頂天”、“立地”兩支隊伍為抓手，深化內涵和質(zhì)量建設，凝練學(xué)科梯隊，構建創(chuàng )新平臺，加速推動(dòng)跨越式發(fā)展，力爭早日躋身國內外高水平農科院校前列。