上海中醫藥大學(xué)基礎醫學(xué)院（中醫基礎理論研究所）是院所合一的二級學(xué)院。其前身為上海中醫學(xué)院基礎部，于1962年10月建立。因其規模和職能的擴展，隨我校更名為上海中醫藥大學(xué)后，于1996年10月改稱(chēng)為基礎醫學(xué)院。

　　基礎醫學(xué)院承擔全校各專(zhuān)業(yè)本科生、研究生的前期中、西醫基礎課程的教學(xué)任務(wù)。學(xué)院下設19個(gè)教研室、3個(gè)研究室、1個(gè)實(shí)驗研究中心（含1個(gè)公共實(shí)驗室、7個(gè)專(zhuān)業(yè)實(shí)驗室），隸屬5個(gè)二級學(xué)科�，F有教職員工176名，其中專(zhuān)任教師158人，具有研究生學(xué)歷者133名（占84％），正高26名、副高45名，終身教授3人。學(xué)院管理的在校學(xué)生近千名，其中碩士生、博士生200余名。學(xué)院設有5個(gè)博士后流動(dòng)站，5個(gè)博士點(diǎn)，5個(gè)碩士點(diǎn)。中醫醫史文獻學(xué)科為國家級重點(diǎn)（培育）學(xué)科，中醫基礎理論學(xué)科是國家中醫藥管理局“十一五”重點(diǎn)學(xué)科，中醫診斷學(xué)學(xué)科、中醫各家學(xué)說(shuō)學(xué)科是國家中醫藥管理局“十二五”重點(diǎn)學(xué)科，中醫診斷學(xué)學(xué)科也是上海市重點(diǎn)學(xué)科，中西醫結合基礎學(xué)科是上海市教委重點(diǎn)學(xué)科。中醫臨床基礎學(xué)科在全國中醫院校中也具有一定的學(xué)術(shù)優(yōu)勢和地位。學(xué)院在開(kāi)展中醫學(xué)術(shù)史研究、中醫藏象研究、中醫“證”的研究、中醫四診客觀(guān)化研究、中醫中藥延緩衰老機理研究、中醫防治亞健康研究、中醫體質(zhì)學(xué)研究等方面均取得可喜成績(jì)，在中西醫結合基礎學(xué)科中創(chuàng )立了具有中醫特色的經(jīng)穴解剖學(xué)，其學(xué)術(shù)水平全國領(lǐng)先。目前，學(xué)院承擔國家和部市級課題20余項，在研課題經(jīng)費總計1600余萬(wàn)。近五年來(lái)，學(xué)院先后主編或副主編國家統編規劃及新世紀課程教材29本。擁有國家級精品課程4門(mén)（實(shí)驗中醫學(xué)、醫古文、內經(jīng)選讀、中醫診斷學(xué)），市級精品課程6門(mén)（實(shí)驗中醫學(xué)、醫古文、內經(jīng)選讀、中醫診斷學(xué)、傷寒論、經(jīng)絡(luò )腧穴解剖學(xué)），是全國理科基礎學(xué)科研究和教學(xué)人才培訓基地，該基地的教學(xué)團隊是國家級教學(xué)團隊。2011年，學(xué)院成為上海市教育系統優(yōu)秀集體。

　　學(xué)院名師輩出，名醫薈萃，金壽山、劉樹(shù)農、張伯訥、殷品之、張震夏、賈福華、沈濟蒼、萬(wàn)淑媛、裘沛然、凌耀星、傅維康、段逸山、柯雪帆、嚴世蕓、趙偉康、嚴振國、曾兆麟、施玉華、顧文聰等著(zhù)名中西醫學(xué)家先后在學(xué)院任教任職。

　　學(xué)院還聘請多名國內外知名專(zhuān)家、教授擔任名譽(yù)教授和客座教授，互訪(fǎng)及學(xué)術(shù)交流頻繁。學(xué)院有多名教授應邀赴美國、法國、日本、韓國、新加坡、澳大利亞等國講學(xué)，在國際上為學(xué)校贏(yíng)得良好聲譽(yù)。

　　長(cháng)期以來(lái)，學(xué)院在歷任領(lǐng)導帶領(lǐng)和廣大教職工共同努力下，為學(xué)校的教學(xué)科研及社會(huì )服務(wù)做出了重大貢獻，成為學(xué)校教育科研事業(yè)的主要支柱�！�