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考試輔導

公衛執業(yè)醫師生物化學(xué)考點(diǎn)

時(shí)間:2025-02-06 05:38:37 考試輔導 我要投稿

2017公衛執業(yè)醫師生物化學(xué)考點(diǎn)

  生物化學(xué)是運用化學(xué)的理論和方法研究生命物質(zhì)的邊緣學(xué)科。其任務(wù)主要是了解生物的化學(xué)組成、結構及生命過(guò)程中各種化學(xué)變化。下面是應屆畢業(yè)生小編為大家搜索整理了2017公衛執業(yè)醫師生物化學(xué)考點(diǎn),希望對大家考試有所幫助。

2017公衛執業(yè)醫師生物化學(xué)考點(diǎn)

  RNA的生物合成

  RNA的生物合成包括轉錄和RNA的復制。

  轉錄(transcription):以一段DNA的遺傳信息為模板,在RNA聚合酶作用下,合成出對應的RNA的過(guò)程,或在DNA指導下合成RNA。

  轉錄產(chǎn)物:mRNA 、rRNA、 tRNA、小RNA

  除某些病毒基因組RNA外,絕大多數RNA分子都來(lái)自DNA轉錄的產(chǎn)物。

  轉錄研究的主要問(wèn)題:

 、賀NA聚合酶 ②轉錄過(guò)程 ③轉錄后加工 ④轉錄的調控

 、賬③是基本內容,④是目前研究的焦點(diǎn),轉錄調控是基因調控的核心。

  轉錄與DNA復制的異同:

  相同:要有模板,新鏈延伸方向5’→3’,堿基的加入嚴格遵循堿基配對原則。

  相異:①復制需要引物,轉錄不需引物。

 、谵D錄時(shí),模板DNA的信息全保留,復制時(shí)模板信息是半保留。

 、坜D錄時(shí),RNA聚合酶只有5’→3’聚合作用,無(wú)5’→3’及3’→5’外切活性。

  轉錄是基因表達的第一步,也是最關(guān)鍵的一步。

  基因表達的終產(chǎn)物:①RNA ②蛋白質(zhì)

  轉錄過(guò)程涉及兩個(gè)方面

 、賀NA合成的酶學(xué)過(guò)程

 、赗NA合成的起始信號和終止信號,即DNA分子上的特定序列。

  DNA正鏈:與mRNA序列相同的DNA鏈。

  負鏈:與正鏈互補的DNA鏈。

  轉錄單位的起點(diǎn)核苷酸為+1,起點(diǎn)右邊為下游(轉錄區),轉錄起點(diǎn)左側為上游,用負數表示:-1,-2,-3。

  DNA指導的RNA合成(轉錄)

  RNA鏈的轉錄,起始于DNA模板的一個(gè)特定位點(diǎn),并在另一位點(diǎn)終止,此轉錄區域稱(chēng)為一個(gè)轉錄單位。一個(gè)轉錄單位可以是一個(gè)基因(真核),也可以是多個(gè)基因(原核)。

  基因的轉錄是有選擇性的,細胞不同生長(cháng)發(fā)育階段和細胞環(huán)境條件的改變,將轉錄不同的基因。

  轉錄的起始由DNA上的啟動(dòng)子區控制,轉錄的終止由DNA上的終止子控制,轉錄是通過(guò)DNA指導的RNA聚合酶來(lái)實(shí)現的。

  一、 RNA聚合酶

  RNA合成的基本特征

 、俚孜铮篘TP(ATP、GTP、CTP、UTP)

 、赗NA鏈生長(cháng)方向:5’→3’

 、鄄恍枰

 、苄鐳NA模板

  反應:

  1、 E.coli RNA聚合酶(原核生物)

  E.coli和其它原核細胞一樣,只有一種RNA聚合酶,合成各種RNA(mRNA、tRNA、rRNA)。

  一個(gè)E.coli細胞中約有7000個(gè)RNA聚合酶分子,在任一時(shí)刻,大部分聚合酶(5000左右)正在參與RNA的合成,具體數量依生長(cháng)條件而定。

  E.coli RNA聚合酶全酶|(holoenzyme)分子量46萬(wàn)Da,由六個(gè)亞基組成,α2ββ’ σω,另有兩個(gè)Zn2+。

  無(wú)σ亞基的酶叫核心酶,核心酶只能使已開(kāi)始合成的RNA鏈延長(cháng),而不具備起始合成活性,加入σ亞基后,全酶才具有起始合成RNA的能力,因此,σ亞基稱(chēng)為起始因子。

  E.coli RNA聚合酶各亞基的大小與功能:

  亞基 亞基數 分子量(KD) 基因 功能

  β’ 1 160 rpoC 模板DNA結合

  β 1 150 rpoB 與核苷酸結合,起始和催化部位。

  σ 1 70 rpoD 起始識別因子

  α 2 37 rpoA 與DNA上啟動(dòng)子結合

  ω 1 不詳

  不同的細菌,β’、β、α亞基分子量變化不大,σ亞基分子量變化較大,44KD~92KD。

  σ亞基的功能:核心酶在DNA上滑動(dòng),σ亞基能增加酶與DNA啟動(dòng)子的結合常數,增加停留時(shí)間,使聚合酶迅速找到啟動(dòng)子并與之結合,σ亞基本身無(wú)催化活性。

  不同的σ因子識別不同的啟動(dòng)子,從而表達不同的基因。

  不同的原核生物,都具有相同的核心酶,但σ亞基有所差別,這決定了原核基因表達的選擇性。

  RNA聚合酶的催化活性:RNA聚合酶以完整的雙鏈DNA為模板,轉錄時(shí)DNA的雙鏈結構部分解開(kāi),轉錄后DNA仍然保持雙鏈的結構。

  核心酶覆蓋60bp的DNA區域,其中解鏈部分17bp左右,RNA-DNA雜合鏈約12bp。

  純的RNA聚合酶,在離體條件下可轉錄雙鏈DNA,但在體內,DNA的兩條鏈中只有一條可用于轉錄,這可能是由于RNA聚合酶在分離時(shí)丟失了σ亞基引起的。

  解旋和重新螺旋化也是RNA聚合酶的內在特性,在酶的前端解螺旋,在后端以相反方向重新螺旋化,活體狀況中,可能還有其它酶活性來(lái)幫助調整DNA的拓撲學(xué)性質(zhì)。

  37℃時(shí),RNA聚合酶的聚合速度可達40~100個(gè)核苷酸/秒

  2、 真核生物RNA聚合酶

  真核生物的轉錄機制要復雜得多,有三種細胞核內的RNA聚合酶:RNA聚合酶I轉錄rRNA,RNA聚合酶II轉錄mRNA,RNA聚合酶III轉錄tRNA和其它小分子RNA。這三種RNA聚合酶分子量都在50萬(wàn)左右,亞基數分別為6-15。

  動(dòng)物、植物、昆蟲(chóng)等不同來(lái)源的細胞,RNApolⅡ的活性都可被低濃度的α-鵝膏蕈堿抑制,而RNApolⅠ不受抑制。

  動(dòng)物RNApolⅢ受高濃度的α-鵝膏蕈堿抑制,而酵母、昆蟲(chóng)的RNApolⅢ不受抑制。

  除了細胞核RNA聚合酶外,還分離到線(xiàn)粒體和葉綠體RNA聚合酶,它們的結構簡(jiǎn)單,能轉錄所有種類(lèi)的RNA,類(lèi)似于細菌RNA聚合酶。

  3、 噬菌體T3和T7編碼的RNA聚合酶

  僅為一條分子量11KD的多肽鏈,這些聚合酶只需要識別噬菌體DNA的少數啟動(dòng)子,并無(wú)選擇地與其作用,37℃時(shí)的聚合速度200nt/秒。

  二、 RNA聚合酶催化的轉錄過(guò)程(E.coli)

  1、 起始

  RNA聚合酶結合到DNA雙鏈的特定部位,局部解開(kāi)雙螺旋,第一個(gè)核苷酸摻入轉錄起始位點(diǎn),從此開(kāi)始RNA鏈的延伸。

  在新合成的RNA鏈的5’末端,通常為帶有三個(gè)磷酸基團的鳥(niǎo)苷或腺苷(pppG或pppA),即合成的第一個(gè)底物是GTP或ATP。

  起始過(guò)程中,σ因子起關(guān)鍵作用,它能使聚合酶迅速地與DNA的啟動(dòng)子結合,σ亞基與β’結合時(shí),β’亞基的構象有利于核心酶與啟動(dòng)子緊密結合,。

  正鏈:與mRNA序列相同的兩、鏈。

  負鏈:模板鏈。

  轉錄起點(diǎn)是+1,上游是-1。

  2、 延長(cháng)

  轉錄起始后,σ亞基釋放,離開(kāi)核心酶,使核心酶的β’亞基構象變化,與DNA模板親和力下降,在DNA上移動(dòng)速度加快,使RNA鏈不斷延長(cháng)。

  轉錄起始后,σ亞基便從全酶中解離出來(lái),然后nusA亞基結合到核心酶上,由nusA亞基識別序列序列。

  3、 終止

  RNA聚合酶到達轉錄終止點(diǎn)時(shí),在終止輔助因子的幫助下,聚合反應停止,RNA鏈和聚合酶脫離DNA模板鏈,nusA又被σ亞基所取代。

  由此形成RNA聚合酶起始復合物與終止復合物兩種形式的循環(huán)

  三、 啟動(dòng)子和轉錄因子

  啟動(dòng)子:RNA聚合酶識別、結合并開(kāi)始轉錄所必需的一段DNA序列。

  轉錄因子:RNA聚合酶在進(jìn)行轉錄時(shí),常需要一些輔助因子(蛋白質(zhì))參與作用,此類(lèi)蛋白質(zhì)統稱(chēng)為轉錄因子。

  足跡法和DNA測序法確定啟動(dòng)子的序列結構。

  (一) 原核啟動(dòng)子結構與功能

  分析比較上百種啟動(dòng)子序列,發(fā)現不同的啟動(dòng)子都存在保守的共同序列,包括RNA聚合酶識別位點(diǎn)和結合位點(diǎn)。

  (1)、 -10序列(Pribnow框)

  在轉錄起點(diǎn)上游大約-10處,有一個(gè)6bp的保守序列TATAAT,稱(chēng)Pribnow框。此段序列出現在-4到-13bp之間,每個(gè)位點(diǎn)的保守性在45%-100%。

  頻度: T89 A89 T50 A65 A65 T100

  據預測,Pribnow框中,一開(kāi)始的TA和第6位最保守的T在結合RNA聚合酶時(shí)起十分重要的作用。

  目前認為,Pribnow框決定轉錄方向。酶在此部位與DNA結合形成穩定的復合物,Pribnow框中DNA序列在轉錄方向上解開(kāi),形成開(kāi)放型起始結構,它是RNA聚合酶牢固的結合位點(diǎn),是啟動(dòng)子的關(guān)鍵部位。

  RNA聚合酶的結合,誘導富含AT的Pribnow框的雙鏈解開(kāi),然后進(jìn)一步擴大成17個(gè)核苷酸長(cháng)度的泡狀物,在泡狀物中RNA聚合酶從模板鏈開(kāi)始轉錄RNA產(chǎn)物。

  (2)、 -35序列(Sexfama box)(識別區域)

  只含-10序列的DNA不能轉錄,在-10序列上游還有一個(gè)保守序列,其中心約在-35位置,稱(chēng)為-35序列,此序列為RNA酶的識別區域。

  各堿基出現頻率如下:T85 T83 G81 A61 C69 A52 ,其中TTG十分保守。

  -35序列的功能:它是原核RNA聚合酶全酶依靠σ因子的初始識別位點(diǎn)。因此,-35序列對RNA聚合酶全酶有很高的親和性。-35序列的核苷酸結構,在很大程度上決定了啟動(dòng)子的強度,RNA聚合酶易識別強的啟動(dòng)子。

  -35序列提供RNA聚合酶識別信號,

  -10序列有助于DNA局部雙鏈解開(kāi),

  啟動(dòng)子結構的不對稱(chēng)性決定了轉錄的方向。

  P364 圖20-4 原核型啟動(dòng)子的結構

  (二) 真核啟動(dòng)子

  真核基因的轉錄十分復雜,對啟動(dòng)子的分析要比原核基因的困難得多。

  真核生物有三種RNA聚合酶:RNA聚合酶I、II、III,分別轉錄rRNA、mRNA、tRNA和小分子RNA,這三類(lèi)聚合酶的啟動(dòng)子各有其結構特點(diǎn)。

  1、 RNA聚合酶Ⅱ的啟動(dòng)子

  RNA聚合酶Ⅱ的啟動(dòng)子有三個(gè)保守區:

  (1)、 TATA框(Hogness框)

  中心在-25至-30,長(cháng)度7bp左右。

  堿基頻率:T82 A97 A85 A63 (T37 )A83 A50(T37 )(全為A-T,少數含有一個(gè)G-C對)。

  此序列功能:使DNA雙鏈解開(kāi),并決定轉錄的起點(diǎn)位置,失去TATA框,轉錄將可能在許多位點(diǎn)上開(kāi)始。

  TATA框的改變或缺失,直接影響DNA與酶的結合程度,會(huì )使轉錄起始點(diǎn)偏移,因此,TATA是絕大多數真核基因正確表達所必需的。

  由于RNA聚合酶分子有相對固定的空間結構,同此框的結合位點(diǎn)和轉錄反應催化位點(diǎn)的距離,決定了起始位點(diǎn)的正確選擇。啟動(dòng)子特定序列和酶的正確結構,這兩者把酶置于一種正確的構象中,決定了識別的正確性和轉錄起始的正確性。

  (2)、 CAAT框

  中心在-75處,9bp,共有序列GGT(G)CAATCT

  功能:與RNA聚合酶結合。

  (3)、 GC框

  在CAAT框上游,序列GGGCGG,與某些轉錄因子結合。

  CAAT和GC框均為上游序列,對轉錄的起始頻率有較大影響。

  2、 RNApolⅢ的啟動(dòng)子

  RNApolⅢ的啟動(dòng)子在轉錄區內部。

  四、 終止子和終止因子

  終止子:提供轉錄終止信號的一段DNA序列。

  終止因子:協(xié)助RNA聚合酶識別終止子的蛋白質(zhì)輔助因子。

  有些終止子的作用可被特異的因子所阻止,使酶越過(guò)終止子繼續轉錄,稱(chēng)為通讀,這類(lèi)引起抗終止作用的蛋白質(zhì)稱(chēng)為抗終止因子。

  終止子位于已轉錄的序列中,DNA的終止子可被RNA聚合酶本身或其輔助因子識別。

  1、 大腸桿菌中的兩類(lèi)終止子

  所有原核生物的終止子在終止點(diǎn)之前都有一個(gè)回文結構,它轉錄出來(lái)的RNA可以形成一個(gè)頸環(huán)式的發(fā)莢結構。

  (1)、 不依賴(lài)于ρ的終止子(簡(jiǎn)單終止子)

  簡(jiǎn)單終止子除具有發(fā)夾結構外,在終止點(diǎn)前有一寡聚U序列,回文對稱(chēng)區通常有一段富含GC的序列。寡聚U序列可能提供信號使RNA聚合酶脫離模板。

  (2)、 依賴(lài)ρ的終止子

  依賴(lài)ρ的終止子,必需在ρ因子存在時(shí),才發(fā)生終止作用。終止點(diǎn)前無(wú)寡聚U序列,回文對稱(chēng)區不富含GC。ρ因子是55KD的蛋白質(zhì),可水解三磷酸核苷。

  2、 抗終止作用

  通讀往往發(fā)生在強啟動(dòng)子、弱終止子的基因上。

  抗終止作用常見(jiàn)于某些噬菌體的時(shí)序控制。早期基因于后基因之間以終止子相隔開(kāi),通過(guò)抗終止作用可以打開(kāi)后基因的表達。

  λ噬菌體前早期(immediate early)基因的產(chǎn)物N蛋白就是一種抗終止因子。它與RNA聚合酶作用使其在左右兩個(gè)終止子處發(fā)生通讀,從而表達晚早期(delayed early)基因。晚早期基因的產(chǎn)物Q蛋白也是一種抗終止因子,它能使晚早期基因得以表達。

  RNA轉錄后的加工

  RNA聚合酶合成的原初轉錄產(chǎn)物,要經(jīng)過(guò)剪切、修飾、拼接等過(guò)程,才能轉變成成熟的RNA分子,此過(guò)程稱(chēng)RNA轉錄后的加工。

  (1)、 原核、真核的tRNA、rRNA(穩定的RNA)

  細胞內的tRNA、rRNA相對穩定,半衰期一般為幾個(gè)小時(shí)。所有的tRNA、rRNA都不是原初轉錄產(chǎn)物,都要經(jīng)過(guò)一系列的加工才能成為有活性的分子。

  a. 原初轉錄產(chǎn)物的5’是三磷酸(pppG、pppA),而成熟的tRNA、rRNA ,5’是單磷酸。

  b. 成熟 tRNA、rRNA分子都比原初轉錄物小。

  c. 所有的tRNA分子,都有原初轉錄物所沒(méi)有的稀有堿基(A、G、C、U以外的堿基)。

  (2)、 真核的mRNA

  單順?lè )醋,多內含子。壽命比原核mRNA的長(cháng)。

  內含子、內元(intron):在原初轉錄物中,通過(guò)RNA拼接反應而被去除的RNA序列,或基因中與這種序列對應的DNA序列。

  外顯子、外元(exon):原初轉錄物通過(guò)RNA拼接反應后,而保留于成熟RNA中的序列,或基因中與成熟RNA對應的DNA序列。

  (3)、 原核mRNA

  多順?lè )醋,半衰期只有幾分鐘。這是原核生物重要的調控機制,如果一種酶或蛋白質(zhì)不再需要時(shí),只需簡(jiǎn)單地關(guān)閉其mRNA的合成就行了。

  一、 原核生物RNA的加工

  在原核生物中,rRNA基因與某些tRNA基因組成混合操縱子,可提高效率、節省空間(增加有效信息)。其它的tRNA基因也成簇存在,并與編碼蛋白質(zhì)的基因組成操縱子,它們在形式多順?lè )醋愚D錄物后,斷裂成為rRNA和tRNA的前體,然后進(jìn)一步加工成熟。

  1、 原核rRNA前體的加工(E.coli)

  E.coli共有三種rRNA

  5S rRNA 120b

  16S rRNA 1541b

  23S rRNA 2904b

  rRNA原初轉錄物含6300個(gè)核苷酸,約30S。

  大腸桿菌有7個(gè)rRNA的轉錄單位(操縱子),它們分散在基因組的各處。每個(gè)轉錄單位由16SrRNA、23SrRNA、5SrRNSA以及一個(gè)或幾個(gè)tRNA基因所組成。每個(gè)操縱子中tRNA基因的種類(lèi)、數量和位置都各不相同。

  RNAaseⅢ是一種rRNA、多順?lè )醋觤RNA加工的內切酶,識別特定的RNA雙螺旋區。

  RNAase E也可識別P5(5SrRNA前體)兩端形成的雙螺旋區。

  2、 原核tRNA前體的加工

  E.coli染色體基因組有60個(gè)tRNA基因,即某種a.a.的tRNA基因不止一個(gè)拷貝。

  tRNA基因大多成簇存在,或與rRNA基因,或與蛋白質(zhì)基因組成混合轉錄單位。

  tRNA前體加工步驟

  a. 核酸內切酶(RNAaseP、RNAaseF)在tRNA兩端切斷。

  b. 核酸外切酶(RNAaseD)從3’端逐個(gè)切去附加序列。

  c. 在tRNA3’端加上-CCA-OH。tRNA核苷酰轉移酶

  d. 核苷的修飾(修飾酶):甲基化酶 / S-腺苷蛋氨酸(SAM),假尿苷合成酶。

  (1)、 RNAase P

  能識別空間結構,很干凈地切除tRNA前體的5’端。

  含有蛋白質(zhì)和RNA(M1 RNA)兩部分。M1 RNA含375nt,在某些條件下,(提高[Mg2+]、或加入胺類(lèi)),RNAase P的RNA能單獨地切斷tRNA前體的5’端序列。

  (2)、 RNAaseF

  不干凈地切除tRNA前體的3’端序列,需要RNAase D進(jìn)一步修剪。

  3、 原核mRNA前體的加工

  由單順?lè )醋訕嫵蒻RNA,一般不需加工,一經(jīng)轉錄,即可直接進(jìn)行翻譯。有些多順?lè )醋訕嫵傻膍RNA,須由核酸內切酶切成較小的mRNA,然后再進(jìn)行翻譯。

  例:核糖體大亞基蛋白L10、L7、L12與RNA聚合酶β、β’亞基的基因組成混合操縱子。

  它在轉錄出多順?lè )醋觤RNA后,由RNAaseⅢ將核糖體蛋白質(zhì)基因與聚合酶亞基基因的mRNA切開(kāi),然后各自翻譯。

  該加工過(guò)程的意義:可對mRNA的翻譯進(jìn)行調節,核糖體蛋白質(zhì)的合成必須適應于rRNA的合成水平,而細胞內RNA聚合酶的合成水平則要低得多。兩者切開(kāi),有利于各自的翻譯調控。

  二、 真核生物RNA的加工

  真核rRNA、tRNA前體的加工過(guò)程與原核的很相似,但mRNA的加工過(guò)程與原核的有很大不同。

  1、 真核rRNA前體的加工

  真核生物核糖體的小亞基含:16-18S rRNA,大亞基含:26-28S r RNA、5S rRNA、5.8S rRNA(特有)。

  真核rRNA基因拷貝數較多,幾十至幾千個(gè)之間。

  真核rRNA基因也成簇排列在一起,18S、5.8S、28S rRNA基因組成一個(gè)轉錄單位,彼此被間隔區分開(kāi),由RNA聚合酶I轉錄生成一個(gè)長(cháng)的rRNA前體。5SrRNA基因也成簇排列,間隔區不被轉錄,由RNA聚合酶III轉錄后經(jīng)適當加工。

  哺乳動(dòng)物:45SrRNA前體,含18S、5.8S、28S rRNA

  果蠅:38SrRNA前體,含18S、5.8S、28S rRNA

  酵母:37SrRNA 前體,17S、5.8S、26S rRNA

  rRNA在成熟過(guò)程中可被甲基化,位點(diǎn)主要在核糖2’-OH上。真核rRNA甲基化程度比原核的高,約1-2%的核苷酸被甲基化。

  真核生物的核仁是rRNA合成、加工和裝配成核糖體的場(chǎng)所,大、小亞基分別組裝后,通過(guò)核孔轉移到胞質(zhì)中參與核糖體循環(huán)。

  2、 真核tRNA前體的加工

  真核tRNA基因的數目比原核tRNA的要多的多。例如,E.coli有60個(gè)tRNA基因,啤酒酵母250個(gè),果蠅850個(gè),爪蟾1150個(gè),人1300個(gè)。

  真核tRNA基因也成簇排列,被間隔區分開(kāi),tRNA基因由RNA聚合酶Ⅲ轉錄。

  真核tRNA前體的剪切、修飾過(guò)程與原核相似。

  3、 真核生物mRNA前體的加工

  mRNA原初轉錄物是分子量很大的前體,在核內加工過(guò)程中形成分子大小不等的中間產(chǎn)物,它們被稱(chēng)為核內不均一RNA(hn RNA)。其中,約有25%可轉變成成熟的mRNA。

  hnRNA半壽期很短,比細胞質(zhì)中的mRNA更不穩定,一般在幾分鐘至1小時(shí)。而細胞質(zhì)mRNA的半壽期為1-10小時(shí),神經(jīng)細胞mRNA最長(cháng)可達數年。

  hnRNA轉變成mRNA的加工過(guò)程主要包括:

  a. 5’末端形成帽子結構

  b. 3’末端切斷并加上polyA

  c. 剪接除去內含子對應的序列

  d. 甲基化

  (1)、 5’末端加帽

  RNA三磷酸酶,mRNA鳥(niǎo)苷酰轉移酶,mRNA(鳥(niǎo)嘌呤-7)甲基轉移酶,mRNA(核苷-2’)甲基轉移酶。

  由于甲基化的程度不同,有三種類(lèi)型的帽子:CAP O型,CAP I型,CAP II型。

  ★5’帽子也出現于hnRNA,說(shuō)明加帽過(guò)程可能在轉錄的早期階段或轉錄終止前就已完成。

  ★5’帽子的功能

  a. 在翻譯過(guò)程中起信號識別作用,協(xié)助核糖體與mRNA結合,使翻譯從AUG開(kāi)始。

  b. 保護mRNA,避免5’端受核酸外切酶的降解。

  (2)、 3’端加polyA

  hnRNA鏈由RNAaseⅢ切斷,由多聚腺苷酸聚合酶催化,加上polyA,ATP為供體。

  加尾信號:AATAAA、YGTGTGYY(Y為嘧啶)。

  高等真核生物和病毒的mRNA在靠近3’端區都有一段非常保守的序列AAUAAA,這一序列離多聚腺苷酸加入位點(diǎn)的距離在11-30nt范圍之內。

  核內hnRNA的3’端也有多聚腺苷酸,表明加尾過(guò)程早在核內已經(jīng)完成。hnRNA中的poly(A)比mRNA略長(cháng),平均150-200nt。

  polyA的功能

  a. 防止核酸外切酶對mRNA信息序列的降解,起緩沖作用。

  b. 與mRNA從細胞核轉移到細胞質(zhì)有關(guān)。

  3’脫氧腺苷(既冬蟲(chóng)夏草素)是多聚腺苷酸化的特異抑制劑,但它不抑制hnRNA的轉錄。

  (3)、 mRNA甲基化

  某些真核mRNA內部有甲基化的位點(diǎn),主要是在N6-甲基腺嘌呤(m6A)。

  三、 RNA的拼接和催化作用(內含子的切除)

  多數真核基因是斷裂基因,其轉錄產(chǎn)物通過(guò)拼接,去除內含子,使編碼區(外顯子)成為連續序列。

  有些內含子可以催化自身的拼接(self-splicing),有些內含子需要在有關(guān)酶的作用下才能拼接。

  1、 tRNA前體的拼接

  酵母tRNA約有400個(gè)基因,有內含子的基因約占1/10,內含子長(cháng)度14-46bp,沒(méi)有保守性。

  切除內含子的酶識別的是tRNA的二級結構,而不是什么保守序列。

  拼接過(guò)程:

  第一步切除內含子,第二步RNA連接酶將兩個(gè)tRNA半分子連接。

  P375圖20-9酵母tRNAPhe及其前體的結構

  P376圖20-10酵母和植物tRNA前體的拼接過(guò)程

  2、 四膜蟲(chóng)rRNA前體的自我拼接

  四膜蟲(chóng)35S rRNA前體,經(jīng)加工可以生成5.8S 、17S和26SrRNA。

  某些品系的四膜蟲(chóng)在其26SrRNA基因中有一個(gè)內含子,35S rRNA前體需要拼接除去內含子。該拼接過(guò)程只需一價(jià)和二價(jià)陽(yáng)離子和鳥(niǎo)苷酸(提供3’-OH),無(wú)需能量和酶。

  3、 mRNA前體的拼接

  真核生物所有編碼蛋白質(zhì)的核結構基因,其內含子的左端均為GT,右端均為AG。此規律稱(chēng)GT-AG規律(對于mRNA就是GU-AG,此規律不適合于線(xiàn)粒體、葉綠體的內含子,也不適合于tRNA和某些rRNA的核結構基因)

  酵母核基因的內含子在靠近3’端還有一個(gè)保守序列,與5’端序列互補,稱(chēng)為T(mén)ACTAAC box,也與拼接有關(guān)。

  真核細胞內存在許多種類(lèi)的小分子RNA,大小在100-300nt,有些由聚合酶III轉錄,有些由聚合酶II轉錄。

  核內小RNA(snRNA)主要存在于核內,細胞質(zhì)小RNA(scRNA)主要存在于細胞質(zhì)。

  重要的snRNA有U系列snRNA,因其尿嘧啶含量高而得名。U系列snRNA通常都與多肽或蛋白質(zhì)結合形成核糖x蛋白顆粒(RNP)。U-snRNA參與hnRNA的拼接過(guò)程。U3-snRNA與rRNA前體的加工有關(guān),U1、U2、U4、U5、U6可能都與hnRNA的加工有關(guān)。

  真核生物編碼蛋白質(zhì)的核基因的內含子屬于II類(lèi)內含子(反式剪接)

  四、 RNA的催化功能

  1、 I類(lèi)內含子的自我剪接(順式剪接)

  I類(lèi)內含子包括四膜蟲(chóng)rRNA的內含子(1981,Cech,美國),幾種酵母線(xiàn)粒體的內含子,噬菌體T4胸苷酸合成酶的內含子(1984,Apirion,美國)等。這些內含子有較大的同源性,可自我拼接。

  2、 獨具催化活性的小分子RNA

  1984,Altman,Pace(美國),細菌加工tRNA前體的酶—RNAase P中的M1RNA在高濃度的Mg2+或胺類(lèi)存在時(shí)能單獨切下tRNA前體的5’端。

  RNA的復制

  有些RNA病毒,進(jìn)入寄主細胞后,借助復制酶而進(jìn)行RNA病毒的復制。從感染RNA病毒的細胞中可以分離出RNA復制酶,這些RNA復制酶的模板特異性很強,只識別病毒自身的RNA,它以病毒RNA為模板,合成與模板性質(zhì)相同的RNA。

  一、 噬菌體QβRNA的復制

  噬菌體Qβ:直徑20nm,正十二面體,含30%RNA,其余為蛋白質(zhì),單鏈RNA,4500個(gè)核苷酸,編碼3-4個(gè)蛋白質(zhì)。

  結構:5’端——成熟蛋白(A或A2蛋白)——外殼蛋白(或A1蛋白)——復制酶β亞基——3’端

  Qβ復制酶:αβγδ四個(gè)亞基,只有β是自己編碼,其余三個(gè)亞基來(lái)自寄主細胞。

  進(jìn)入E.coli細胞后,其RNA即為mRNA,可以直接合成與病毒繁殖有關(guān)的蛋白質(zhì)(復制酶β亞基)。

  QβRNA的復制過(guò)程:在Qβ特異的復制酶合成并裝備好后就開(kāi)始病毒RNA的復制。

  QβRNA翻譯和復制的自我調節:

  QβRNA的高級結構(尤其是雙螺旋區的結構)參與翻譯的調節控制:

  (1) 只有剛復制的QβRNA,成熟蛋白基因才能翻譯。

  (2) 核糖體能直接啟動(dòng)外殼蛋白基因的翻譯

  (3) 復制酶β亞基基因只有在外殼蛋白合成時(shí)雙鏈打開(kāi)才能進(jìn)行翻譯。

  QβRNA的翻譯、復制受寄主細胞調節,以正鏈RNA為模板復制負鏈RNA時(shí),另需寄主細胞的HFⅠ和HFⅡ因子。而以負鏈RNA 為模板復制正鏈RNA時(shí),不需這兩個(gè)因子,感染后期大量合成的是正鏈RNA。

  二、 病毒RNA復制的主要方式

  1、 正鏈RNA病毒(mRNA):噬菌體Qβ、灰質(zhì)炎病毒等。

  進(jìn)入寄主細胞后,利用寄主的翻譯系統,首先合成復制酶及有關(guān)的蛋白質(zhì),然后進(jìn)行病毒RNA的復制,最后由病毒RNA和蛋白質(zhì)裝配成病毒顆粒。

  2、 負鏈RNA病毒(帶有復制酶):狂犬病毒等

  此類(lèi)病毒帶有復制酶,侵入后,復制酶首先合成出正鏈RNA(mRNA),再以正鏈RNA為模板,合成負鏈RNA及蛋白質(zhì),然后裝配。

  3、 雙鏈RNA病毒(帶有復制酶):呼腸孤病毒等

  以雙鏈RNA為模板,在復制酶作用下先轉錄正鏈RNA(mRNA),從而翻譯出蛋白質(zhì),然后合成負鏈RNA,形成雙鏈RNA,再包裝。

  4、 反轉錄病毒(含反轉錄酶):白血病病毒、肉瘤病毒等致癌RNA病毒

  正鏈RNA病毒,它們的復制需要經(jīng)過(guò)DNA前病毒階段。

  RNA生物合成的抑制劑

  某些核酸代謝的拮抗物和抗生素可抑制核苷酸或核酸的合成,因而可以用于抗病毒或抗腫瘤藥物,也可以用于核酸的研究

  一、 嘌呤和嘧啶類(lèi)似物

  抑制核苷酸的合成,還能摻入核酸分子中去,形成異常DNA、RNA,影響核酸功能。

  主要有:6-巰基嘌呤、硫鳥(niǎo)嘌呤、2.6—二氨基嘌呤、8-氮鳥(niǎo)嘌呤、5-氟尿嘧啶 、6-氮尿嘧啶。堿基類(lèi)似物進(jìn)入體內后需轉變成相應的核苷酸,才表現出抑制作用。

  二、 DNA模板功能的抑制劑

  此類(lèi)化合物能與DNA結合,使DNA失去模板功能,從而抑制其復制與轉錄。

  1、 烷化劑

  氮芥(二(氯乙基)胺的衍生物)、磺酸酯、氮丙啶、乙撐亞胺類(lèi)。它們帶有活性烷基,使DNA烷基化。

  烷化位點(diǎn):鳥(niǎo)嘌呤N7 ,腺嘌呤N1、N3、N7,胞嘧啶N1

  烷基化后,堿基易被水解下來(lái),留下的空隙可干擾DNA復制或引起錯誤堿基摻入。帶有雙功能基團的烷化劑,可同時(shí)與DNA兩條鏈結合,使雙鏈DNA交聯(lián),從而失去模板功能。

  環(huán)磷酰胺:腫瘤細胞中磷酰胺酶活化,生成活性氮芥。

  苯丁酸氮芥:癌細胞酵解作用強,乳酸多,pH低,苯丁酸氮芥易進(jìn)入。

  2、 放線(xiàn)菌素D(對真核、原核細胞都起作用)

  有抗菌和抗癌作用。

  它可與DNA形成非共價(jià)復合物,使其多肽部分在DNA的“淺溝”上如同阻遏蛋白一樣,抑制DNA的轉錄和復制。

  此類(lèi)機理的放線(xiàn)菌素還有色霉素A3、橄欖霉素、光神霉素。

  3、 嵌入染料

  扁平芳香族染料,可插入雙鏈DNA相鄰堿基對之間。

  溴化乙錠插入后,使DNA在復制時(shí)缺失或增添一個(gè)核苷酸,從而導致移碼突變,并能抑制RNA鏈的起始及質(zhì)粒的復制。此外還有原黃素、吖啶黃、吖啶橙等。

  三、 RNA聚合酶的抑制物

  1、 利福霉素

  包括其衍生物利福平,特異地抑制細菌RNA聚合酶的活性。

  強烈抑制革蘭氏陽(yáng)性菌和結核桿菌,它主要抑制RNA合成的起始。

  2、 利鏈菌素

  與細菌RNA聚合酶β亞基結合,抑制轉錄過(guò)程中鏈的延長(cháng)。

  3、 α-鵝膏蕈堿

  主要抑制真核RNA聚合酶Ⅱ和Ⅲ,對細菌的RNA聚合酶作用極小。

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